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Study : 1711044752

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3063541
1711044752
멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발
미래부
서울대학교
김선
2016
2016-11-01     ~      2017-08-31
김선
sunkim.bioinfo@snu.ac.kr
028807280

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 분석 프로그램   2. 기타 분석

한글명칭 딥팸
영문명칭 DeepFam
프로그램 DeepFam-master.zip
매뉴얼 매뉴얼 다운로드
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소
주요 내용 특징 딥팸은 다중 서열 정렬법을 사용하는 기존의 단백질군 분류 방법에서 벗어나 컨볼류션 뉴럴 네트워크를 활용하여 정렬법 없이도 빠르고 높은 정확도를 보이는 분류 알고리즘이다. 딥러닝의 특징 상 학습시 많은 데이터와 큰 컴퓨터 리소스 그리고 오랜 시간이 필요하지만, 한 번 학습된 모델의 처리 속도는 기존 은닉마르코프모델을 사용한 방법론보다 훨씬 빠르다.
주요 기능 단백질 시퀀스 내에서 유사한 모티프 혹은 도메인을 공유하는 단백질군을 학습하여 모르는 단백질이 들어왔을 때 해당 단백질의 군을 예측하고 그에 따른 기능 또한 예측한다.
사용방법
LINUX
기타